SARS-CoV-2 핵단백질의 화학주성 인자: Octet® BLI를 활용한 단백질 도메인 매핑

저자:

데이비드 아피요, PhD

애플리케이션 수석 관리자, 싸토리우스

밥 다스, PhD

애플리케이션 선임 과학자, 싸토리우스

알베르토 도밍고 로페스-무뇨스, PhD

국립보건원(NIH) 선임 박사후 연구원


2023년 9월

개요

면역 요법은 암, 알츠하이머병, 염증성 질환 및 항바이러스 반응과 같은 질병과 싸우는 중요한 전략입니다. 면역 시스템과 그 구성 요소를 조작하고 조절하는 것은 핵심 전략입니다. 약물 개발 및 치료를 위한 주요 전략에는 사이토카인 및 케모카인(주화성 사이토카인; CHKs), 그들의 수용체(G 단백질 결합 수용체; GPCRs)와 같은 면역 조절제를 표적으로 삼고, CAR-T 세포 치료와 같은 T 세포를 포함한 면역 세포를 조절하며, 이중 및 삼중 특이적 항체와 같은 면역 세포 연결제(ICE)를 사용하는 것이 포함됩니다.

선천성 면역 시스템의 주요 구성 요소와 항원 간의 생분자 상호작용에 참여하는 단백질 도메인의 특성 규명은 약물 발견, 백신 개발 및 항원 지도 작성에 중요한 통찰력을 제공합니다. 주어진 단백질 내에서 이러한 상호작용 도메인을 식별하고 매핑하는 것은 도전적이고, 노동 집약적이며, 시간이 많이 소요될 수 있습니다. 이는 알라닌 스캐닝, 도피 돌연변이 생성, 심층 돌연변이 스캐닝과 같은 기술을 사용해야 합니다. Octet® 생체층 간섭계(BLI) 플랫폼을 활용하는 유체 없는 접근 방식은 상호작용하는 항원 도메인과 실시간 에피토프 다양성의 신속하고, 라벨 없는, 고처리량 분석을 가능하게 합니다.

이 응용 노트는 Octet® BLI 플랫폼에서 생분자 상호작용의 단백질 도메인 매핑을 위한 모델로, SARS-CoV-2 핵단백질(N) (최초로 분비된 인간 코로나바이러스 바이러스 케모카인 결합 단백질; vCBP로 제시)과 인간 케모카인 간의 상호작용을 논의하고 포괄적으로 특성을 규명합니다. 또한 분석 개발 및 최적화를 위한 지침과 고려 사항을 제공합니다.


  • 응용 노트
  • 12분
  • 20분


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주요 내용

  • SARS-CoV-2 핵단백질(N)과 인간 케모카인 간의 상호작용 특성화
  • 실시간으로 상호작용하는 항원 도메인과 에피토프 다양성을 분석하기 위한 신속하고 라벨 없는 고처리량 플랫폼
  • 검정법 개발 및 최적화를 위한 지침 및 고려사항

생체분자 상호작용 모델을 위한 케모카인과 SARS-CoV-2 핵단백질: Octet® BLI 애플리케이션 노트를 활용한 단백질 도메인 매핑

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