COVID-19 연구

싸토리우스의 Octet® BLI 플랫폼에 대한 COVID-19 연구

싸토리우스는 SARS-CoV-2 바이러스에 대한 치료제와 백신을 찾기 위한 전 세계 연구자들의 노력을 지원하기로 결정했습니다. 분자 수준 연구는 일반적으로 인체 내 안지오텐신 전환 효소 2(ACE2) 수용체를 통해 호흡기 점막 세포에 대한 SARS-CoV-2의 결합 상호작용과 같이 바이러스의 감염성 결정 요인을 이해하는 데 사용됩니다.

최신 애플리케이션 노트에서 Octet® 바이오-레이어 간섭계(BLI) 플랫폼은 감염 중 관여하는 다양한 분자(ACE2 단백질, 스파이크 단백질-S, 수용체 결합 도메인 및 삼량체 SARS-CoV-2 S 단백질)에 대한 SARS-CoV-2의 결합을 특성화하는 데 사용됩니다. 이 첨단 시스템이 분자 상호작용 중 작용하는 열역학을 신속하게 평가하는 방법을 확인하세요.

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COVID-19 연구

코로나19 염기서열이 2020년 1월에 처음 공유된 이후, Octet® BLI 데이터는 코로나바이러스 생물학, 백신 및 항바이러스 치료제 개발과 관련된 여러 획기적인 연구 논문에 소개되었습니다. 아래의 요약 테이블과 추가 리소스 탭은 Octet® BLI 시스템이 COVID-19 바이러스 입자의 결합 동역학, 친화력, 중화, 교차 차단 또는 역가를 규명하는 데 중요한 역할을 한 몇 가지 초기 연구 논문을 제공합니다.

분석 대상

고정된 리간드

바이러스 종

분석 포커스

바이오센서

참고문헌

ACE2

Fc 태그된 SARS CoV-2 RBD

SARS CoV-2

교차 반응성 및 수용체 결합

AHC

[1]

ACE2

SARS-CoV-2 SB SARS-CoV SB

SARS CoV-2

수용체 결합

HIS1K

[2]

단일클론 항체, MERS S 단백질, VHH

SARS CoV-2 S1, SARS CoV-2 수용체 결합 도메인

SARS CoV-2

VHH 및 단일클론 항체 결합 평가, 에피토프 분류

AR2G

[3]

Fab, 면역글로불린 G

사스 코로나바이러스-2 S 단백질, 사스 코로나바이러스-2 수용체 결합 부위

SARS CoV-2

FAB, IgG 결합 특성화

HIS1K

[4]

ACE2, SARS-CoV RBD

SARS-CoV 특이적 중화 항체

SARS CoV-2

교차 반응성 결합

싸토리우스

[5]

항체

생물틴-재조합 SARS-CoV S1 단백질

SARS CoV-2

중화 항체 평가

싸토리우스

[6]

FAB, ACE2, SARS S 단백질

단클론항체, ACE2

SARS CoV-2

수용체 결합, 항체 반응성, 경쟁 분석

AHC, HIS1K

[7]

SARS CoV-2 RBD

억제제 펩타이드

SARS CoV-2

펩타이드 억제제 개발

싸토리우스

[8]

단클론 항체

S1B 과 SARS Secto 도메인

SARS CoV와 SARS CoV-2

항체 반응성 평가

HIS1K

[9]

SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD, 단클론항체, FAB

단클론항체, SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD

SARS CoV와 SARS CoV-2

항체 결합 특성 분석, 에피토프 빈닝, 경쟁적 결합

단백질 A, HIS2, HIS1K

[10]

코로나바이러스 S 단백질

비오틴-9OAc6SLN

사스 코로나바이러스와 메르스 코로나바이러스

수용체 결합

싸토리우스

[11]

메르스-5HB 융합 억제제

비오틴-펩타이드 (메르스-HR2P)

메르스 코로나바이러스

단백질 억제제 개발

싸토리우스

[12]

단클론항체, 메르스 S 단백질

단클론항체, 메르스 S 단백질

메르스 코로나바이러스

에피토프 빈닝 및 수용체 결합

SAX, 단백질 A

[13]

MERS-CoV S

단클론 항체

메르스 코로나바이러스

항체 반응성 측정, 경쟁 분석

AHC, HIS1K

[14]

MERS-CoV NTD, 돌연변이체

단클론 항체

메르스 코로나바이러스

항체 반응성 측정

AHC

[15]

메르스 S-단백질

단클론 항체

메르스 코로나바이러스

항체 반응성 측정

AHC

[16]

RBD, S1, S2 도메인

백신 유도 마우스 단클론 항체

메르스 코로나바이러스

항체 반응성 및 에피토프 분류

AHC, HIS1K

[17]

FABs

메르스-CoV RBD

메르스 코로나바이러스

에피토프 빈닝

HIS1K

[18]

RBD

ACE2

사스-CoV-2

결합 친화력

AHQ

[19]

다중 특이적, 다중 친화성 항체

RBD

사스-CoV-2

결합 동역학

NTA

[20]

ACE2

RBD

사스-CoV-2

항체 결합 특성 분석, 에피토프 빈닝, 경쟁적 결합

단백질 A

[21]

r-스파이크 외막 단백질, 면역글로불린 G

단클론항체, 스파이크 외막 단백질

사스-CoV-2

항체 결합 특성 분석, 에피토프 빈닝, 경쟁적 결합

AMC, SA

[22]

면역글로불린 G

RBD

사스-CoV-2

에피토프 빈닝

AHC

[23]

ACE2-PD, B38 항체

P2 S

사스-CoV-2

BNT 162b2 RNA 후 발현 및 수용체 친화성

싸토리우스, 단백질 G

[24]

Octet® BLI 플랫폼은 과학자들에게 다음과 같은 방식으로 코로나19 연구 가속화를 지원하고 있습니다:

  • 백신 및 치료제 후보를 빠르게 선별하기 위한 고처리량 동역학적 상호작용 분석 솔루션
  • 항체 에피토프 특성 분석 및 범위 결정을 위한 빠르고 유연한 플랫폼
  • 백신 및 바이오 치료제 개발 연구를 위해 맞춤 제작된 다양한 범위의 바이오센서를 활용한 효율적인 워크플로우
  • 백신 효능, 안정성 및 역가 측정과 같은 백신 개발 및 제조의 상류 및 하류 과정에 대한 다목적 솔루션
  • 직관적이고 사용하기 쉬운 데이터 분석 소프트웨어 도구

결합 동역학 특성 분석

상하이 푸단대학의 잉 등과 우한 바이러스 연구소의 다른 연구자들은 2019-nCoV 스파이크 단백질에 대한 항-SARS CoV 항체의 교차 반응성을 평가했으며, 2019-nCoV와 SARS-CoV의 수용체 결합 도메인(RBD)의 상대적으로 높은 동일성을 고려했습니다. 그들은 Octet® 시스템에서 얻은 데이터를 사용하여 처음으로 SARS-CoV 특이적 인간 단클론 항체인 CR3022가 2019-nCoV RBD와 강력하게 결합할 수 있음을 보고했습니다(KD 6.3 nM). 이러한 결과는 효과적인 항바이러스 치료제 및 백신 개발에 중요합니다.

조이스 등도 SARS-CoV-2 S RBD의 고해상도 결정 구조를 사용하여 유사한 관찰 결과를 보고했습니다. SARS-CoV 및 MERS CoV RBD와 상호작용하는 것으로 알려진 항체들을 Octet® 시스템을 사용하여 SARS-CoV-2 결합 활성에 대해 테스트했습니다. 항체 풀 중 240CD와 CR3022 두 개의 항체만이 SARS-CoV 2 RBD에 대해 낮은 나노몰 결합 친화도를 보였습니다.

퓨단 대학의 잉 등은 SARS-CoV-2 RBD를 대상으로 하는 단일 도메인 항체의 생성 및 테스트를 설명하는 또 다른 논문을 발표했습니다. SARS-CoV-2 RBD와 S1을 항원으로 사용한 패닝 결과, SARS-CoV-2 RBD의 5가지 중화 또는 비중화 에피토프를 대상으로 하는 항체를 식별했습니다. 이 중 18개가 추가 연구를 위해 선택되었습니다. 이들은 Octet®와 ELISA로 측정한 결과, 서브나노몰에서 나노몰 친화력으로 SARS-CoV-2 RBD에 강력하고 특이적으로 결합했습니다.

바이러스 결합 및 교차 반응성의 신속한 결정

SARS-CoV-2 RBD를 대상으로 하는 단일 도메인 항체에 관한 논문에서, 잉 등은 Octet® 시스템을 사용한 경쟁적 결합 분석에서 18개의 인간 단일 도메인 항체를 테스트하여 서로 경쟁하지 않는 세 가지 경쟁 그룹(A, B 또는 C)으로 나눌 수 있음을 발견했습니다.

논문 읽기

COVID-19 결합 에피토프에 대한 인사이트

옥텟® 기술은 전 세계 과학자들이 최근 코로나바이러스(COVID-19) 발병에 대해 더 많이 알아가는 데 도움을 주고 있습니다. 이 전단지에서는 연구자들이 백신 개발의 첫 단계로 바이러스의 결합 메커니즘을 이해하기 위해 옥텟® 시스템을 사용하는 많은 사례 중 두 가지를 강조합니다.

전단지 다운로드

빠르고 정밀한 인플루엔자 백신 효능 분석

백신 제조 과정에서 백신 역가를 신속하고 정확하게 측정하는 것은 백신 개발 공정 성능을 이해하고 각 공정 단계를 올바르게 조정하는 데 중요합니다. Octet® 플랫폼은 96웰 또는 384웰 플레이트 형식의 고처리량 특성을 정밀도와 재현성 개선과 결합하며, 더 간단하고 직접적인 백신/항원-항체 결합 측정 방법에서 유래되었습니다. 이 플랫폼은 공정 개발 그룹에 SRID 방법에 대한 견고하고 사용하기 쉬운 대안을 제공합니다. Octet® 플랫폼은 96웰 플레이트의 샘플에 대해 검사 시간을 며칠에서 단 몇 시간으로 단축합니다.

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Aptamer 그룹, 정확한 결과를 위해 Octet® RH16 시스템 활용

COVID-19 연구에서 SARS CoV-2의 S1 단백질이 치료제의 주요 타겟으로 부각되었습니다. Aptamer 그룹의 한 팀은 SARS CoV-2 스파이크의 S1 단백질에 선택적으로 결합할 수 있는 단클론 아프타머를 성공적으로 분리했습니다. 이들은 Octet® RH16 시스템을 사용하여 아프타머를 SARS CoV-2 및 관련 바이러스에 대해 테스트하고, 다른 부위에 결합하는 아프타머를 식별했습니다.

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글로벌 코로나19 연구

세계보건기구(WHO)에서 매일 업데이트하는 코로나19에 대한 글로벌 연구. -

전 세계 연구 커뮤니티가 사용할 수 있도록 코로나바이러스 계열 바이러스에 대해 전문 텍스트를 포함한 52,000개 이상의 학술 논문으로 구성된 COVID-19 오픈 연구 데이터셋(CORD-19)을 준비하고 배포하기 위해 선도적인 연구 그룹들과 협력해왔습니다. 아래 링크에서 데이터베이스의 온라인 전문 검색이 가능합니다. Octet® 제품을 바이러스 연구에 참조한 출판물 검색도 수행할 수 있습니다. -

연구자, 비영리 단체, 상업 조직을 위한 COVID-19 및 코로나바이러스 관련 연구의 공개 펀딩 모집 및 지원 목록을 매일 유지하고 업데이트합니다. -

국립보건원(NIH)에서 모든 코로나바이러스 관련 펀딩 기회를 나열합니다. -

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